MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022358	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022358	TCAAG	2	10	828	837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022358	CA	3	6	842	847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022358	CAC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022358	CA	4	8	994	1001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022358	ATA	2	6	1050	1055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022358	T	6	6	1103	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022358	ATAA	2	8	1109	1116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022358	AT	3	6	1123	1128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022358	TATT	2	8	1148	1155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022358	CAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022358	CAAA	2	8	1179	1186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022358	CAT	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022358	AC	3	6	1224	1229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022358	TGA	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022358	TGC	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022358	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022358	C	6	6	3167	3172	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_022358	TG	3	6	3301	3306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022358	GGT	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022358	AGT	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022358	TGA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022358	GGT	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022358	GTG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022358	GGT	2	6	3572	3577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022358	GGT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022358	CTG	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022358	ATA	2	6	3690	3695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022358	TGT	3	9	3723	3731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022358	T	6	6	3739	3744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022358	CAA	2	6	3860	3865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022358	A	6	6	3942	3947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022358	AGATC	2	10	4010	4019	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022358	GCC	2	6	5894	5899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022358	GGT	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022358	GCA	2	6	6975	6980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022358	A	6	6	7021	7026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022358	T	7	7	7073	7079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022358	A	7	7	7202	7208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022358	C	6	6	7229	7234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_022358	GAA	2	6	7262	7267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022358	A	7	7	7332	7338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022358	TGT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022358	ATT	2	6	7376	7381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022358	ATAA	2	8	7453	7460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022358	AATT	2	8	7496	7503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022358	TCA	2	6	7522	7527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022358	GTT	2	6	7528	7533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022358	A	7	7	7562	7568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022358	GT	3	6	7649	7654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022358	TCT	2	6	9517	9522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022358	A	6	6	9529	9534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022358	CTT	2	6	9609	9614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022358	TA	3	6	9745	9750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022358	AT	3	6	9785	9790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022358	CTG	2	6	9816	9821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022358	GAA	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022358	TCT	2	6	9838	9843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022358	T	6	6	9862	9867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022358	GCG	2	6	9892	9897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022358	ATTG	2	8	9914	9921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022358	TTA	2	6	9922	9927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022358	ATT	2	6	10014	10019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022358	CAATC	2	10	10091	10100	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_022358	GGA	2	6	10164	10169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022358	AGTTG	2	10	10179	10188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022358	A	6	6	10245	10250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022358	A	7	7	10260	10266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022358	GAC	2	6	10513	10518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022358	TCA	2	6	10596	10601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022358	TCCCC	2	10	11055	11064	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_022358	GAC	2	6	11631	11636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022358	AAG	2	6	11660	11665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022358	CA	3	6	11671	11676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022358	TA	4	8	11980	11987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022358	GCAT	2	8	12007	12014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022358	ATG	2	6	12035	12040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022358	T	6	6	12754	12759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022358	A	6	6	12918	12923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022358	T	7	7	12944	12950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022358	GAGG	2	8	12974	12981	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022358	A	6	6	13026	13031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022358	TGG	2	6	13103	13108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022358	ATT	2	6	13754	13759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022358	GGC	3	9	13816	13824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022358	CCA	2	6	13836	13841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_022358	TCTA	2	8	13854	13861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022358	GGC	2	6	16187	16192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022358	GTG	2	6	16229	16234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022358	GCC	2	6	16235	16240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022358	GCC	2	6	16267	16272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_022358	AG	3	6	16277	16282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022358	GCT	2	6	16308	16313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022358	TAA	2	6	16315	16320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022358	T	6	6	16374	16379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022358	TCA	2	6	16462	16467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022358	CAG	2	6	16488	16493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022358	G	6	6	16588	16593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022358	GTA	2	6	16963	16968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022358	A	6	6	17163	17168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022358	A	6	6	18121	18126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022358	TAT	2	6	20128	20133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022358	AGA	2	6	20243	20248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022358	GCG	2	6	20256	20261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022358	T	6	6	20322	20327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022358	ATC	2	6	20380	20385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022358	GCG	2	6	20477	20482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022358	TCG	2	6	20542	20547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022358	CGC	2	6	20558	20563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022358	GCT	2	6	20648	20653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022358	TTTA	2	8	20686	20693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022358	A	6	6	21779	21784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022358	ACG	2	6	23107	23112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022358	AGC	2	6	23171	23176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022358	T	7	7	23187	23193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022358	ATC	2	6	23245	23250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022358	CGG	2	6	23257	23262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022358	GGT	2	6	23289	23294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022358	AAT	2	6	23307	23312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022358	AAGT	2	8	24806	24813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022358	TGC	2	6	24997	25002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022358	AGTT	2	8	25032	25039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022358	AATA	2	8	25056	25063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022358	ATT	2	6	25116	25121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022358	A	6	6	25228	25233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022358	ATA	2	6	25241	25246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022358	GATT	2	8	25275	25282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022358	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022358	A	6	6	25335	25340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022358	TAC	2	6	25461	25466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022358	AC	4	8	25465	25472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022358	AT	3	6	25524	25529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022358	CCGT	2	8	25532	25539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022358	C	7	7	25545	25551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_022358	CCA	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022358	TAT	2	6	25598	25603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022358	TAC	2	6	26310	26315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022358	ATG	2	6	26349	26354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022358	TAT	2	6	26470	26475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022358	CAG	2	6	27109	27114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022358	CAT	2	6	28416	28421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022358	AAT	2	6	28527	28532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022358	CCT	2	6	29439	29444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_022358	GGC	2	6	48223	48228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022358	CT	4	8	48291	48298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022358	GAT	2	6	48371	48376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022358	TGCAT	2	10	48379	48388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022358	GC	3	6	50300	50305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022358	CGG	2	6	50309	50314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022358	TCT	2	6	50330	50335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022358	ATC	2	6	50339	50344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022358	GC	3	6	50349	50354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022358	CCA	2	6	52863	52868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_022358	CT	3	6	61444	61449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_022358	ACGA	2	8	61488	61495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_022358	CCG	2	6	62049	62054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_022358	TCC	2	6	62753	62758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_022358	ATC	2	6	64240	64245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_022358	CTC	2	6	64246	64251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_022358	CTC	2	6	67365	67370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_022358	AT	3	6	68350	68355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022358	A	7	7	68362	68368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022358	GC	3	6	68788	68793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_022358	ATG	2	6	68802	68807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022358	TCCC	2	8	68837	68844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
166	NC_022358	TTC	2	6	68890	68895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_022358	C	6	6	68897	68902	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
168	NC_022358	T	6	6	68924	68929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022358	AAT	2	6	70501	70506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022358	T	6	6	70515	70520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022358	CAC	2	6	71987	71992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_022358	A	6	6	72030	72035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022358	TCC	2	6	75247	75252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_022358	CCT	2	6	76019	76024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_022358	CGA	2	6	76101	76106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_022358	AT	3	6	80146	80151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022358	GTG	2	6	80155	80160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022358	TTGGC	2	10	80201	80210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_022358	ACC	2	6	80321	80326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_022358	TGCT	2	8	84000	84007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_022358	CA	3	6	84083	84088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_022358	GCT	2	6	84107	84112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_022358	GGT	2	6	86268	86273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_022358	TAC	2	6	86515	86520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_022358	CT	3	6	86597	86602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.